中医病因学的基本概念应包括病因的概念和病因学说的概念。
1、病因的概念，是指引起疾病的原因，又称为致病因素。如《医学源流论病同因别论》曰：凡人之所苦，谓之病；所以致此病者，谓之因。”
引起疾病的原因很多，中医认为主要有六淫、疠气、七情、饮食、劳逸、外伤、寄生虫、药邪、医过、先天因素。这些因素都可影响或破坏人体内部各脏腑组织之间，以及人体与外环境之间的相对平衡协调状态，产生疾病。
疾病过程的本质是病因与人体相互作用的综合结果。疾病的发生与演变绝不是病因单方面作用所决定的，不同的个体对病因的伤害作用、对抗和转化的反应不同，病因的含义实际上包括了影响与作用于致病原和机体双方的因素。
2、病因学说的概念，是指研究病因的性质及其致病特点的学说。病因性质，是指不同病因具有不同的特性。致病特点，是指不同的致病因素作用于人体的形态结构、功能活动、物质基础所反映的临床特征。一般来说，病因性质决定致病特点，致病特点反映病因性质。故研究病因性质和致病特点对于诊断和防治疾病具有重要意义。